Το παλαιό Μουσείο Επιδαύρου δεν επαρκούσε για να καλυφθούν οι ανάγκες των σημαντικών για ολόκληρο τον ελληνικό πολιτισμό, όχι μόνο για την περιοχή και τα πέριξ, εκθεμάτων του. Έτσι, το Κεντρικό Αρχαιολογικό Μουσείο αποφάσισε τη δημιουργία νέου, και δη στη θέση του ιστορικού ξενοδοχείου «Ξενία». Σε έναν υπερσύγχρονο χώρο 2.500 τετραγωνικών μέτρων θα τοποθετηθούν τα σπουδαία ευρήματα από το ιερό του Ασκληπιού, προκειμένου να βρίσκονται εκεί όπου τους αξίζει.
Το σημείο βρίσκεται εκτός του μνημειακού συνόλου του Ασκληπιείου, όπου δεν υπάρχουν αρχαιολογικά κατάλοιπα. Στην ίδια περιοχή είναι ήδη υπό ανέγερση το πωλητήριο του Οργανισμού Διαχείρισης και Ανάπτυξης Πολιτιστικών Πόρων (ΟΔΑΠ), καθώς και κτίριο πολλαπλών χρήσεων για το Ελληνικό Φεστιβάλ.
Οι χρήσεις που προτείνονται για το νέο κτίριο του μουσείου από την αρμόδια Εφορεία Αρχαιοτήτων Αργολίδας θέλουν τη μόνιμη έκθεση να υποδέχεται τον επισκέπτη στο ισόγειο του κτιρίου και να καταλαμβάνει έκταση 1.100 τετραγωνικών μέτρων. Ένα μέρος των πλούσιων εκθεμάτων παρουσιάζεται βεβαίως στο υπάρχον κτίριο, ωστόσο είναι εμφανής η συμφόρηση.
Το παλαιό μουσείο κατασκευάστηκε στις αρχές του εικοστού αιώνα για να στεγάσει τις αποκαταστάσεις του Μνημείου του Ασκληπιείου, καθώς και τα εξαιρετικά ευρήματα ανασκαφών στην περιοχή. Από τα σημαντικότερα εκθέματα που θα κοσμήσουν το νέο μουσείο στην Επίδαυρο είναι ο θριγκός του Ναού του Ασκληπιού (380-575 π.Χ.), ο θριγκός του Ναού της Αρτέμιδος (370-310 π.Χ.) και το άγαλμα του θεού Ασκληπιού (αντίγραφο).
Τα εκθέματα του μουσείου χρονολογούνται από την αρχαϊκή έως τη ρωμαϊκή εποχή και περιλαμβάνουν: επιγραφές, ιατρικά εργαλεία, σίμες αρχαίων κτιρίων, ακροκέραμα, ανάγλυφα, αγάλματα μεγάλου μεγέθους. Επίσης, αναθήματα μικρού μεγέθους, καθώς και τμήματα εμβληματικών αρχαίων κτιρίων από το ιερό του Ασκληπιού.